Een paniekstoornis zonder andere psychische stoornissen wordt in behandelsettings weinig aangetroffen. In de algemene bevolking had 80% van de personen met een paniekstoornis een levenslange comorbide psychische aandoening. De prevalentie van de paniekstoornis is verhoogd onder mensen met daarnaast andere stoornissen, vooral andere angststoornissen (in het bijzonder agorafobie), een depressieve stoornis, een bipolaire-I- of -II-stoornis en mogelijk ook een lichte stoornis in het gebruik van alcohol. De paniekstoornis ontstaat soms op jongere leeftijd dan de comorbide stoornis(sen), maar ook vaak later dan de comorbide stoornis, en in dat geval kan de paniekstoornis worden beschouwd als een marker voor de ernst van de comorbide stoornis.
De beschreven percentages van comorbiditeit tussen de depressieve stoornis en de paniekstoornis variëren enorm: van 10 tot 65% bij mensen met een paniekstoornis. Bij ongeveer een derde van de mensen met beide stoornissen gaat de depressiviteit vooraf aan het ontstaan van de paniekstoornis. Voor de overige twee derde van deze groep geldt dat de depressiviteit gelijktijdig met of na het ontstaan van de paniekstoornis optreedt. Een subgroep van de mensen met een paniekstoornis ontwikkelt een middelgerelateerde stoornis, wat voor sommigen van hen een uiting kan zijn van een poging tot zelfmedicatie van hun angstsymptomen met alcohol of geneesmiddelen. Ook comorbiditeit met andere angststoornissen en de ziekteangststoornis komt algemeen voor.
Er bestaat een aanzienlijke comorbiditeit van de paniekstoornis met tal van algemeen voorkomende somatische symptomen en aandoeningen, waaronder duizeligheid, cardiale aritmieën, hyperthyreoïdie, astma, COPD en het prikkelbaredarmsyndroom. Het blijft echter onduidelijk wat nu precies het verband (oorzaak en effect bijvoorbeeld) is tussen paniekstoornis en deze stoornissen. De mitraalklepprolaps en schildklieraandoeningen komen vaker voor bij mensen met een paniekstoornis dan bij de bevolking als geheel, maar de toenames in de prevalentie zijn niet consistent.
