Nachtmerries kunnen comorbide zijn met een groot aantal somatische aandoeningen, inclusief coronaire hartziekte, kanker, parkinsonisme en pijn, en kunnen gepaard gaan met somatische behandelingen zoals hemodialyse of onthouding van medicatie of drugs. Nachtmerries komen vaak gelijktijdig met andere psychische stoornissen voor, inclusief PTSS, de acute stressstoornis, de insomniastoornis, de remslaapgedragsstoornis, en psychotische, stemmings-, angst-, aanpassings- en persoonlijkheidsstoornissen. Ook bij intens verdriet tijdens rouw kunnen nachtmerries voorkomen. Een comorbide nachtmerriestoornis moet alleen worden overwogen wanneer afzonderlijke aandacht gerechtvaardigd is. Deze aandoeningen moeten worden vermeld met de juiste specificatie voor de comorbide stoornis (bijvoorbeeld: met remslaapgedragsstoornis); zie ook de subparagraaf ‘Registratieprocedures’.