Genetica en fysiologie Tot de prenatale oorzaken behoren genetische syndromen (zoals sequentievarianten of copy number variants van een of meer genen; chromosomale stoornissen), aangeboren fouten in de stofwisseling, hersenafwijkingen, ziekten van de moeder (waaronder ziekten van de placenta), en omgevingsfactoren (zoals gebruik van alcohol, drugs, gifstoffen of teratogene stoffen). Perinatale oorzaken betreffen diverse gebeurtenissen rond de bevalling en de geboorte die leiden tot neonatale encefalopathie. Tot de postnatale oorzaken behoren hypoxischischemische schade, traumatisch hersenletsel, infecties, demyelinisatiestoornissen, convulsiestoornissen (bijvoorbeeld infantiele spasmen), ernstige en chronische sociale deprivatie, en toxische stofwisselingssyndromen en vergiftigingen (zoals door lood, kwik).