Idiopathische slaapgerelateerde hypoventilatie bij volwassenen is uitermate ongewoon. De prevalentie van congenitale centrale alveolaire hypoventilatie is niet bekend, maar de stoornis komt zelden voor. Comorbide slaapgerelateerde hypoventilatie komt vaker voor (comorbide hypoventilatie bij andere stoornissen of aandoeningen, zoals COPD, neuromusculaire stoornissen of obesitas).
De prevalentie van comorbide slaapgerelateerde hypoventilatie als gevolg van obesitas in de algemene bevolking wordt op basis van nationale obesitascijfers en de prevalentie van obstructieve slaapapneu in verschillende landen geschat op 0,14 tot 0,6%. De toename van obesitas hangt samen met een hogere prevalentie van obesitas-hypoventilatie. Bij mensen die naar een slaapkliniek worden verwezen en die een BMI hebben hoger dan 35 kg/m2, kan de prevalentie oplopen tot 42%.