De slaapgerelateerde hypoventilatie kan op zichzelf staan of, zoals vaker het geval is, voorkomen als comorbide stoornis bij somatische stoornissen, medicatiegebruik of een stoornis in het gebruik van een middel. Klachten hoeven niet altijd aanwezig te zijn om de diagnose te kunnen stellen. Mensen rapporteren overmatige slaperigheid overdag, frequente arousals en ontwaakmomenten ’s nachts, ochtendhoofdpijn en insomniaklachten.