Hoewel veel mensen met een bipolaire-II-stoornis tussen de stemmingsepisoden in weer volledig functioneren, disfunctioneert minstens 15% in enige mate tussen de episoden en heeft 20% een directe overgang naar een andere stemmingsepisode, zonder tussentijds herstel. Het functionele herstel is aanzienlijk trager dan het herstel van de symptomen van de bipolaire-II-stoornis, vooral wat betreft het beroep. Daardoor wordt vaak een lagere sociaaleconomische status bereikt, ondanks een opleidingsniveau dat vergelijkbaar is met dat in de algemene bevolking. Mensen met een bipolaire-II-stoornis presteren slechter bij cognitieve tests dan gezonde mensen. De cognitieve beperkingen bij een bipolaire-II-stoornis kunnen bijdragen aan beroepsmatige problemen. Langdurige werkloosheid bij mensen met een bipolaire stoornis hangt samen met een groter aantal depressieve episoden, een hogere leeftijd, een verhoogde frequentie van de huidige paniekstoornis en een levenslange voorgeschiedenis van een stoornis in het gebruik van alcohol.
