Stoornissen die vaak tegelijk voorkomen met de coördinatieontwikkelingsstoornis zijn onder andere de communicatiestoornis; de specifieke leerstoornis (in het bijzonder in lezen en schrijven); aandachtsproblemen, waaronder ADHD (de stoornis die het meest met de coördinatieontwikkelingsstoornis samengaat, in ongeveer 50% van de gevallen); de autismespectrumstoornis; disruptieve en emotionele gedragsproblemen; en het hypermobiliteitssyndroom. Er kan sprake zijn van verschillende clusters van comorbiditeit (zoals een cluster met ernstige leesstoornissen, problemen met de fijne motoriek en schrijfproblemen; een ander cluster met een verstoorde motorische controle en motorische planning). De aanwezigheid van andere stoornissen sluit de coördinatieontwikkelingsstoornis niet uit, maar kan het testen bemoeilijken en kan de uitvoering van algemene dagelijkse levensverrichtingen belemmeren, wat betekent dat een clinicus moet beoordelen of er sprake is van een beperking van de motorische vaardigheden.
