Andere neurocognitieve stoornissen Andere neurodegeneratieve ziekten zijn te onderscheiden van frontotemporale NCS aan de hand van hun specifieke kenmerken. Bij de NCS door de ziekte van Alzheimer vormt een achteruitgang in het leervermogen en het geheugen een vroeg kenmerk. Echter, 10 tot 30% van de mensen met een syndroom dat op frontotemporale NCS lijkt, blijkt bij autopsie alzheimerpathologie te hebben. Dat gebeurt vaker bij mensen die zich hebben gemeld met progressieve stoornissen in de executieve functies in afwezigheid van gedragsveranderingen of een bewegingsstoornis, of bij mensen met de logopenische variant.
Bij NCS met lewylichaampjes moeten zowel de hoofdkenmerken als suggestieve kenmerken van lewylichaampjes aanwezig zijn. Bij de NCS door de ziekte van Parkinson treden de symptomen van parkinsonisme ruim voor de cognitieve achteruitgang op. Bij vasculaire NCS kan er afhankelijk van de aangedane hersengebieden ook sprake zijn van een achteruitgang in de executieve vaardigheden en van gedragsveranderingen, zoals apathie. Deze stoornis zou dan ook moeten worden meegenomen in de differentiële diagnostiek. Een doorgemaakt cerebrovasculair incident is echter temporeel gerelateerd aan het begin van de cognitieve beperking bij vasculaire NCS, en uit beeldvormend hersenonderzoek zal dan blijken dat er infarcten of laesies in de witte stof zijn die het klinische beeld verklaren.
Andere neurologische aandoeningen Frontotemporale NCS vertoont in klinische en pathologische zin een overlap met progressieve supranucleaire parese, corticobasale degeneratie en amyotrofe laterale sclerose. Progressieve supranucleaire parese wordt gekenmerkt door supranucleaire blikparese en overwegend axiaal parkinsonisme. Er kunnen pseudobulbaire verschijnselen aanwezig zijn en er is vaak duidelijk sprake van retropulsie (achterwaarts verlies van evenwicht). Bij neurocognitief onderzoek blijkt er psychomotorische vertraging te zijn, evenals een beperkt werkgeheugen en executief disfunctioneren. Corticobasale degeneratie gaat gepaard met asymmetrische stijfheid, apraxie van de ledematen, houdingsinstabiliteit, myoclonus, alien-hand-syndroom en verlies van corticale zintuiglijke waarneming. Veel mensen met de gedragsvariant van frontotemporale NCS vertonen kenmerken van amyotrofe laterale sclerose.
Andere psychische stoornissen en somatische aandoeningen De gedragsvariant van frontotemporale NCS kan ten onrechte worden aangezien voor een onafhankelijke psychische stoornis, zoals een depressieve stoornis, een bipolaire-stemmingsstoornis of schizofrenie, en mensen met deze variant melden zich vaak eerst aan bij de psychiatrie. Na verloop van tijd zal het ontstaan van progressieve neurocognitieve moeilijkheden het onderscheid vergemakkelijken. Een zorgvuldig somatisch onderzoek helpt bij het uitsluiten van behandelbare oorzaken van NCS, zoals metabole stoornissen, voedingsdeficiënties en infecties. Indien naar het oordeel van de clinicus de symptomen die kenmerkend zijn voor een onafhankelijke psychische stoornis (bijvoorbeeld wanen) worden veroorzaakt door de fysiologische effecten van frontotemporale degeneratie, dan dient de classificatie voor de toepasselijke psychische stoornis door frontotemporale degeneratie te worden toegekend, in plaats van die van de onafhankelijke psychotische stoornis (bijvoorbeeld psychotische stoornis door frontotemporale degeneratie, met wanen).