Psychische comorbide stoornissen bij de pedofiele stoornis zijn de stoornissen in het gebruik van een middel; depressieve- en bipolaire-stemmingsstoornissen en angststoornissen; de antisociale-persoonlijkheidsstoornis; en andere parafiele stoornissen. De wetenschappelijke bevindingen over comorbiditeit zijn echter grotendeels gebaseerd op onderzoek bij mensen die veroordeeld zijn voor seksuele misdrijven met kinderen (vrijwel altijd mannen) en zijn wellicht niet te generaliseren naar alle mensen met een pedofiele stoornis (dat wil zeggen: mensen die nooit een kind seksueel benaderd hebben maar wel voor de classificatie in aanmerking komen vanwege persoonlijke lijdensdruk).