Suïcide is een groot risico bij deze stoornis, dat in de late adolescentie en jongvolwassenheid aanzienlijk toeneemt. Analyses van de Canadese nationale database met gegevens over FASD tonen aan dat er een aanzienlijk hoger risico is op suïcidegedachten of suïcidaal gedrag bij mensen met FASD met een disfunctie in de emotieregulatie. Een databaseonderzoek in de Canadese provincie Alberta toonde aan dat mensen met een foetaal alcoholsyndroom een aanzienlijk groter risico lopen op vroegtijdig overlijden; 15% van hen sterft aan suïcide. In Californië werden in een onderzoek onder 54 adolescenten met FASD in de leeftijd van 13–18 jaar ook aanzienlijk hogere percentages gevonden van suïcidale gedachten en ernstige pogingen (alle door jongens), in vergelijking met adolescenten in de algemene bevolking van de Verenigde Staten. In een Canadees enquêteonderzoek hadden de moeders van een kind met FASD, in vergelijking met moeders van wie het kind geen FASD had, een meer dan zes keer zo grote kans om te sterven door suïcide, en een bijna vijf keer zo grote kans om een suïcidepoging te doen na de geboorte van hun kind. Dit duidt erop dat de hogere prevalentie van suïcidegedachten en -pogingen onder jongeren met FASD mogelijk is gemedieerd door gezinsfactoren (genetische en/of omgevingsfactoren), naast het suïciderisico dat voortvloeit uit FASD zelf.