De CZS-disfunctie bij mensen met NCS-PBA resulteert uiteindelijk vaak in een geleidelijke afname van het aanpassingsvermogen en in maladaptief gedrag met levenslange gevolgen. NCS-PBA houdt verband met afwijkingen in meerdere orgaansystemen, waaronder dat van het hart, de nieren, de lever, het maag-darmkanaal en het endocriene systeem. Mensen die prenataal zijn blootgesteld aan alcohol, hebben een hogere prevalentie van het niet afmaken van school, problemen met werk of werkloosheid, in aanraking komen met justitie, opsluiting in een instelling (penitentiair of psychiatrisch), en begeleid wonen.
