Niet-seksuele psychische stoornissen Er bestaat een sterk verband tussen de depressieve stoornis en de erectiestoornis. Als de erectieproblemen beter worden verklaard door een andere psychische stoornis, zoals de depressieve stoornis, dan wordt de classificatie erectiestoornis niet toegekend.
Normale erectiele functie Er moet rekening worden gehouden met de mogelijkheid dat de erectie normaal is en dat de betrokkene te hoge verwachtingen heeft.
Gebruik van een middel/medicatie Als het ontstaan van de erectiele disfunctie samenvalt met het begin van het gebruik van een middel/medicatie, en het probleem verdwijnt zodra het gebruik is gestopt of de dosering is verlaagd, moet in plaats van de erectiestoornis de classificatie seksuele disfunctie door een middel/medicatie worden toegekend.
Somatische aandoeningen Het moeilijkste aspect van de differentiële diagnostiek is het uitsluiten van erectieproblemen die volledig worden verklaard door somatische factoren. Dit soort gevallen krijgt geen psychische stoornis als classificatie. Het onderscheid tussen de erectiestoornis als een psychische stoornis en een erectiele disfunctie als gevolg van een somatische aandoening is gewoonlijk onduidelijk, en in veel gevallen zal er sprake zijn van een complexe interactie van somatische en psychische etiologische factoren. Als de betrokkene ouder is dan 40–50 jaar en/of bijkomende somatische problemen heeft, moeten somatische oorzaken, met name vaataandoeningen, in de differentiële diagnostiek worden opgenomen. De aanwezigheid van een somatische ziekte waarvan bekend is dat deze erectieproblemen veroorzaakt, betekent niet automatisch dat er een causaal verband is. Een man met diabetes mellitus kan bijvoorbeeld een erectiestoornis ontwikkelen als reactie op de psychische belasting door de ziekte. Over het algemeen is het zo dat een erectiele disfunctie door somatische factoren gegeneraliseerd is en geleidelijk ontstaat. Uitzondering hierop zijn erectieproblemen na een traumatische beschadiging van de genitale innervatie (zoals bij een beschadiging van het ruggenmerg). Erectieproblemen die situationeel en wisselend optreden en die acuut ontstaan na een stressvolle levensgebeurtenis, hebben het vaakst een psychische achtergrond. Ook een leeftijd van jonger dan 40 jaar wijst op een psychische etiologie van de moeilijkheden.