Een verscheidenheid van somatische aandoeningen kan katatonie veroorzaken, vooral neurologische aandoeningen (bijvoorbeeld neoplasmata, schedeltrauma, cerebrovasculaire aandoeningen, encefalitis) en stofwisselingsziekten (zoals hypercalciëmie, hepatische encefalopathie, homocystinurie, diabetische ketoacidose). De uitslagen van lichamelijk onderzoek en laboratoriumonderzoek en de patronen van de prevalentie en het begin van de stoornis weerspiegelen die van de etiologische somatische aandoening.